1相关文献（references）和重要文献的更新
论文怎么引用文献，引用什么文献是一个必须重视的细节。比如投稿之前最好先搜索一下Scopus，Pubmed等数据库，以确保没有遗漏最近发表的和论文非常密切相关的文献。
论文遗漏了密切相关的文献对审稿过程可能造成的比较严重的后果有两种：
一种后果是相关文献可能直接影响到论文的新颖性（novelty）和重要性（significance）。有没有足够的新颖性和重要性是不少杂志特别是影响力大的杂志对论文的关键要求之一，这个关不把好就容易造成投错杂志，从而影响了论文发表的效率。
另一种情况是，相关的文献和论文的结论并没有太大的正面冲突，或者从深度到数据质量都比论文差多了。但这也最好先和编辑甚至审稿人等解释清楚，以避免造成不必要的误会。如果故意不提或忽略了便白白错过了这样一个解释的机会。
在这里要注意的是有一些明显的overlap可能不能只在cover letter里解释，因为如果送审的话审稿人往往是看不到cover letter的，这种情况下有时候甚至在论文的Discussion里直接提及，然后看看审稿人和编辑同不同意你的看法，发表以后也可以看看读者是否同意你的看法。
有些文章没有漏掉新发表的文章，却漏掉了和课题直接相关的一些重要文献。这种遗漏不能算是文章的硬伤之一，但有时能给审稿人等一个不好的第一印象，比如作者对领域不够熟悉，脉搏把握得不够到位等等。
2实验细节的交代
在论文里找不到关键的细节可能是最令编辑和审稿人头疼和沮丧的事情之一。有时候打开一篇文章，从结果（Results）到实验步骤（Experimental Procedures，Materials and Methods，etc）到附图及附图说明（Figures, Figure Legends）甚至到补充材料（Supplemental Materials），就愣是找不到关于一个具体的实验到底是怎么做的说明。
比如用的是什么细胞呢，什么样的溶液呢，用的药品是什么浓度呢，如果是小鼠实验又到底用了几只老鼠呢，试验重复了几次呢，p值又是怎么算出来的呢，如果是涉及到病人的样品这些病人的诊断和治疗史又是什么呢，等等等等。
这些细节至关紧要，而不是可有可无，因为没有了这些细节有时候无论是一般读者还是审稿人都可能无法阐释实验结果或者确定它的真伪，结果就是把大家的时间都浪费了，自然也把审稿机会给浪费了。把必要的细节交代清楚还直接影响到实验的可重复性，论文发表了但全世界没有哪个实验室能够重复的多半不是件好事情。
那么怎样交待这些细节呢？最关键的细节我觉得需要放在文章的主体里（附图或附表及说明，实验步骤等），而不应该放在补充材料里或者只列个参考文献完事。
还有一个容易忽略的细节是附图说明的写作。不少论文的附图说明似乎只是在重复实验结论或者对细节轻描淡写地带过，完全不足以让读者包括审稿人弄明白图表或者搞清楚实验的思路，参照等等，这又怎么能让审稿人写个好的评语呢。
很多科研人员可能都碰到过写作疲劳的情况，论文到最后有时真的不想多看一眼了，呵呵。这个可以理解，但不能作为马马虎虎的理由。特别是文章一旦发表就和你的名字绑在一块儿了，千万不能在这个时候松懈。
如果觉得可能自己对论文已经太熟悉而不容易发现问题了，同事或同学之间不妨在这个时候发挥一下互助精神，请别人从一般读者或审稿人的角度把文章读一遍，看看文章有没有破绽或错误，读不读得明白等等。
3图表的次序安排
一篇一流的文章，除了实验结果漂亮，图表的次序往往也特别合理，逻辑性很强，一环扣一环，看了第一个图想到的问题接着在第二个图就能找到答案，好像大家心有灵犀似的。
读这种文章是一种享受。写作的过程中多想想怎么安排次序可能更合理，更能表达文章的重点和新颖点，更能增强文章的可读性，是另一个我认为不应该被忽略的细节。
4投稿之前的最后复查
见过不少投稿以后的论文，里面还有不少写作进行时的痕迹，比如引用文献时写“(Smith et al., ???)”, 引用附图时写“As shown in Figure XX”。或者附图和说明张冠李戴，或者实验结果里描述完第一张图就跳到第四张去了，然后又跑回来第二幅图，或者有5个panel的图在实验结果里就只描述4个，那第五个放在那里干吗呢？
总结
这些令人哭笑不得的细节上的马虎，很多时候会有形无形地影响了文章的可读性和审稿的效率，甚至能降低论文被接受的可能性。有些审稿人还会因此产生疑问：作者连写文章都写得这么粗枝大叶，我怎么能有信心他的结果不会是错的？
总而言之，在论文写作上细节也可以决定成败。Devil is in the details and it is usually all in the details.
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